1.取出肉和果實：
我們常見的可可豆，其實是藏在可可果裡面，可可果很堅硬，必須用鐵鎚敲成兩半，裡頭白白的果肉包覆著可可豆，直接吃味道就像山竹，若要做成巧克力則須經過發酵。
可可果莢可達1斤重，必須剖開才有可可果實
2.發酵：
可可豆本身帶有強烈的酸味，須經發酵過程去酸，可分成兩個階段，首先挖出果肉和可可豆，放到用木頭做成的發酵箱，此時屬於厭氧發酵，所以不能翻攪，大約放置兩天後，再和空氣一起發酵，這時就需要不斷翻攪，發酵溫度需達47度C，大約進行三天，可可豆的酸味會漸漸變淡，但又不能太淡，中間的拿捏就是師傅的功力了，多悶一小時，可能一箱40公斤可可豆全部壞光光，屏東縣內埔文化促進協會總幹事黃琬倫說，最終味道就像「很酸的工研醋」。
放進木頭做的發酵箱厭氧發酵至少2天
3.曝曬：
發酵後的可可果，白色果肉會消失，此時需要在陽光下曝曬，將水分從60%降低到6～7.5%，而且黃琬倫說，不知為何，可可果只能在陽光下曝曬，否則風味就是沒那麼好，而且還不能用太強的陽光曬，否則太快乾燥，酸味會被鎖在殼裡，慢慢曬才能讓酸味逸散出來。夏天在屏東大概早上6點到10點、下午2點到3點曬，有時遇到雷陣雨還要趕快收起來，否則淋雨就全泡湯了。
用陽光曝曬，將水分含量降低至6~7
4.烘烤、脫皮：
就像咖啡豆一樣，巧克力的烘烤技術也是決定風味的關鍵，好的可可豆要用低溫長時間烘烤，大約100~110度C，烘烤40~50分鐘，慢慢去掉酸味。
烘好的可可豆會放進脫皮機，將比較堅硬的外殼去除，裡面的碎粒就是之後要研磨成巧克力的材料。也可不脫殼直接吃，味道酸中帶苦。脫去的殼可直接泡茶，味道溫潤有清香。
可可豆的外殼，可以直接泡茶
5.磨成可可膏：
可可豆經過烘烤、脫殼、破碎後，再來要經過粗磨、精磨，就會變成我們常見的液體狀巧克力，這個程序至少要耗時72~84小時，最後加糖，放入模子定型，就成為可可磚了，台灣業者多半是進口這個階段的巧克力。研磨是影響巧克力口感細膩度的重要關鍵。此外，國外可可豆在粗磨後會將巧克力的靈魂可可脂抽走另外販售，目前台灣則完整保留，口感更滑潤。
有些國外業者會在這個階段，用特殊機器榨出可可豆裡面的油脂，也就是可可脂，屬於植物油，另外販售，可可脂每公斤高達千元，可以做化妝品、醫美用品等等；被榨完油脂的可可塊，可再磨成可可粉，直接沖泡，或是混入不同比例的可可脂、乳化劑等等，做成我們吃的巧克力，其中調配的比例、原料，就是各巧克力大廠的獨家秘方。
也就是說，我們常吃的巧克力，很多都不是原本的可可豆，而是重組了不同比例的可可脂，不過，目前屏東可可多半不會另外榨出可可脂，而是直接定型做成巧克力，所以想吃到原汁原味的巧克力，請認明屏東製造。
屏東可可被抽出可可脂後，剩下可可固塊做成可可粉
多數人還不知道，台灣已經可以種出可可樹，做出專屬台灣的巧克力。約莫10多年前，屏東內埔有農民輾轉帶回可可苗試種，沒想到這個原本只適宜在熱帶雨林的植物，一遇上屏東的高溫陽光、內埔的多雨，加上遍地檳榔的多蔭，如雨林般的環境就此讓其蓬勃茂密，並讓果實帶有濃厚堅果香。
近年台灣檳榔不景氣，加上在地物產意識抬頭，可可就此在屏東檳榔園間找到棲身地，農民們一傳十、十傳百，迅速分株，將其種在檳榔樹下，短短幾年，現在包含屏東內埔與萬巒已有數百農戶種出數百公頃可可樹，並有數家已開始自己採果、取豆、發酵，自製巧克力，或與農民契作可可樹，台灣的巧克力正要開始紮根與茁壯。
每年3、4月春暖與9、10月秋涼，正是台灣可可樹收成季節。